考古發掘通常采用開掘探溝或探方的方法，依據地層學原理，依照遺址中文化層的層次作井然有序的發掘，以正確判斷遺存間的相對早晚關系。對于墓葬，則注意清理有無封土、葬具、尸骨和隨葬品。對房址，根據不同地區不同時期有不同的注意事項，主要則是注意清理房屋面向、柱洞、有無夯筑、灶臺、周圍有無散水以及能否根據屋內殘跡推斷出梁架結構等。窯址的發掘和房址近似。發掘中用照相、測繪、文字記錄等各種方法記錄文化層堆積情況和遺跡、遺物狀況，并全面收集、登記出土物。發掘過程中要全面收集遺物，并記錄遺跡現象，要能夠根據記錄和出土物恢復遺址和墓葬的原貌。